При неспецифических воспалительных заболеваниях легких микробиологическому исследованию может подвергаться следующий материал:
•           мокрота;
•           жидкость БАЛ или промывные воды бронхов;
•           аспирированная жидкость из трахеи, иногда — пунктат из трахеи;
•           щеточные соскобы при бронхиальной браш-биопсии;
•           легочная ткань (пункция и/или биопсия).

и др.

Мокрота. До настоящего времени микробиологическое исследование у пульмонологических больных, как правило, начинается с изучения мокроты. Вместе с тем хорошо известны недостатки этого материала: возможная неравномерность обсеменения его и зараженность посторонней микрофлорой из верхних дыхательных путей и ротовой полости. Широкое использование мокроты объясняется прежде всего легкостью многократного получения
большого количества этого материала как в условиях стационара, так и в амбулатории. Утренняя порция мокроты наиболее богата микрофлорой, поэтому исследование бронхиального секрета, скопившегося в легких в течение ночи, значительно эффективнее. Чтобы преодолеть возможное неравномерное распределение микробной флоры в мокроте, необходимо исследовать большое ее количество: гомогенат всей утренней порции после удаления слюны или не менее 1 мл при использовании метода «отмывки».
Для уменьшения попадания в исследуемые порции мокроты посторонней микрофлоры перед отхаркиванием необходимо полоскать полость рта раствором слабого антисептика, например фурацилина, а затем кипяченой водой для удаления последнего.
Чтобы освободить мокроту от наслоившейся флоры рта и глотки, проводится трехкратная механическая «отмывка» выделенных слизистых комочков секрета в стерильном физиологическом растворе или используется количественный метод исследования. В качестве дополнительного способа может быть использован параллельный посев мокроты и материала, взятого мазком с задней стенки глотки до откашливания секрета. Разница между микрофлорой этих двух материалов дает возможность судить о микроорганизмах, принадлежащих бронхиальному секрету. Однако возможность заражения глотки микрофлорой мокроты и носительство патогенных и условно патогенных агентов снижают достоверность последнего способа.
При соблюдении правил сбора и обработки мокроты результаты ее исследования позволяют с определенной степенью достоверности судить о микрофлоре нижних отделов дыхательного тракта и патологического очага в легочной паренхиме.

Взятие мокроты необходимо производить до еды, после полоскания зева и полости рта теплой водой или раствором питьевой соды (1 чайная ложка на стакан воды). Мокроту при свободном откашливании (лучше — первую утреннюю порцию) необходимо собрать в стерильный контейнер с крышкой. Если мокрота отделяется плохо, то следует накануне дать пациенту отхаркивающие средства. В некоторых случаях мокрота лучше отходит после выпитого теплого чая. Правильно собранная мокрота является слизисто-гнойной или гнойной, иногда — с зелеными включениями и прожилками крови.
Характерными признаками неправильно собранной мокроты являются:
•           пенистый или слизистый характер;
•           водянистость;
•           белый цвет, наличие частиц пищи.
При наличии вышеперечисленных признаков сбор мокроты следует повторить.

Аспират и смывы из бронхов. Наиболее достоверно удается определить микробную флору бронхиального секрета после аспирации его через бронхоскоп или катетер. Однако забор секрета часто затруднен из-за его вязкой консистенции или небольшого количества. Поэтому обычно делают смыв из бронхов физиологическим раствором, что значительно снижает микробиологическую ценность этого метода из-за иногда значительного разведения секрета и отрицательного действия физиологического раствора на чувствительные микроорганизмы. При бронхоскопии и катетеризации удается получить смыв вблизи очага поражения. Тем не менее эндоскопические манипуляции довольно трудоемки и неприятны для больного, что иногда препятствует проведению повторных исследований. К тому же при введении бронхоскопа и катетера не исключается возможность занесения в бронхи микроорганизмов из верхних дыхательных путей.

Мазки из гортани и зева. При отсутствии мокроты или очень скудном ее количестве, особенно у маленьких детей, производится микробиологическое исследование мазков из гортани (с голосовых связок). Результаты посева мазка из зева очень трудно интерпретировать при наличии местных очагов инфекции и из-за возможного носительства патогенных и условно патогенных микроорганизмов. Количественное исследование этого материала дает возможность судить о соотношении между различными группами микроорганизмов.

Кровь. Целесообразно, особенно в остром периоде заболевания, одновременно с исследованием мокроты производить посев крови, так как при некоторых инфекционных процессах в первые дни болезни или при вновь наступившем ухудшении состояния больного наблюдается бактериемия. Появление микроорганизмов в крови может быть связано с резким снижением иммунологической реактивности организма и генерализацией инфекции, что является плохим прогностическим признаком. Так, согласно литературным данным при пневмококковых пневмониях диплококки обнаруживаются в крови у 3—25% больных, причем четвертая часть этих больных погибала, тогда как при отсутствии бактериемии уровень летальности был в 7—8 раз ниже.

Пунктам из абсцесса и из плевральной полости. Микробиологическое исследование пунктата из абсцесса дает возможность определить возбудитель или микрофлору абсцесса до его прорыва в дренирующий бронх.

Исследование плеврального экссудата способствует определению природы заболевания, а динамическое наблюдение с помощью количественного метода необходимо для определения эффективности лечения инфекционного процесса в плевральной полости.